مستند «آقا مرتضی» در قالب هفت قسمت، به بررسی زندگی، تفکرات و فعالیت‌های شهید سید مرتضی آوینی، نویسنده و مستندساز انقلابی، می‌پردازد.این اثر با ارائه روایتی نسبتاً کامل از دوران جوانی تا لحظه شهادت، جنبه‌های گوناگون شخصیت او را به تصویر می‌کشد.مستند تلاش دارد تا نقش آوینی در شکل‌دهی به گفتمان فرهنگی و هنری انقلاب را بازنمایی کند و تأثیر آثار ماندگار او بر مستندسازی و ادبیات معاصر ایران را بررسی نماید.